院校专业组平行志愿投档是以院校专业组为基本投档单位，按照“分数优先、遵循志愿、一轮投档”的规则进行投档和录取。具体来说有三个步骤。
第一，按投档成绩将每个类别的考生从高到低排队。在对同一批(段)次的平行志愿进行投档时，每个类别都有一个队列，谁的投档成绩高，谁就排在某个队列的靠前位置。
第二，按每个队列的考生顺序，依次浏览不同考生的志愿。只有前面考生的档案去向明确后，系统才会浏览紧随其后那位考生的志愿。比如，小明和小花读的都是物理类(普通类)，小明531分，小花530分，小明刚好排在小花的前面一位。投档时，系统先浏览小明的志愿，等小明的档案去向明确后，再浏览小花的志愿。
第三，具体到某一位考生的志愿，则按照该考生填报的院校专业组顺序依次浏览。系统投档时，先浏览你所填报的第1个院校专业组，如果这个院校专业组此时还有空余计划，说明它的招生计划还没有被排在你前面的所有考生“用”完，你的档案可以投进这个院校专业组;如果第1个院校专业组满员了，再查阅你的第2个院校专业组是否有空余计划，如有计划则投档，如没有计划则浏览你的第3个院校专业组，依此类推。如果系统浏览完你填报的最后一个院校专业组仍没有空余计划，表明你此次投档滑档，那么，就需要密切关注这个批次的征集志愿，或参加下一批次投档。
